Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms