Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAAF1Q8NEP3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAAF1Q8NEP3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms