Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPPQ6IPU0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms