Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.188e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.399e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.58e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.578e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-11■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.636e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.236e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.237e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 45.34□□□□□ -1.557e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 A2M-202ENST00000404455 623 ntTSL 55.34□□□□□ -1.557e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.455e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.265e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 48.94□□□□□ -0.985e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.285e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 220.71■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.783e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.53e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.373e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-209ENST00000441488 2816 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.553e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.773e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.73e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.283e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 NFS1-208ENST00000440385 1794 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-13■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 28.46□□□□□ -1.051e-13■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.117e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-206ENST00000546833 952 ntTSL 514.65□□□□□ -0.067e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.127e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.167e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.257e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.257e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-211ENST00000550340 563 ntTSL 411.83□□□□□ -0.527e-8■■□□□ 13.9
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ILF3Q12906 SUOX-212ENST00000550478 613 ntTSL 39.88□□□□□ -0.837e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-213ENST00000551698 598 ntTSL 49.62□□□□□ -0.877e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-210ENST00000550121 547 ntTSL 47.71□□□□□ -1.187e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-217ENST00000552813 703 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.187e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SUOX-207ENST00000547586 556 ntTSL 47.08□□□□□ -1.287e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.317e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.237e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-211ENST00000496908 342 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.27e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.247e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.587e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.677e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-212ENST00000611468 603 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.677e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-202ENST00000369957 784 ntTSL 39.08□□□□□ -0.967e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-204ENST00000415944 413 ntTSL 58.19□□□□□ -1.17e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-220ENST00000631210 490 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.117e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-219ENST00000630151 322 ntTSL 55.99□□□□□ -1.457e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-223ENST00000637791 101 ntTSL 54.7□□□□□ -1.667e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MECP2-222ENST00000637533 140 ntTSL 51.52□□□□□ -2.177e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 13e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.133e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.64e-11■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 RN7SL735P-201ENST00000471015 292 ntBASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SPN-204ENST00000561857 2077 nt10.06□□□□□ -0.82e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 LRP8-211ENST00000496580 507 ntTSL 211.13□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.772e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.082e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)8.13□□□□□ -1.112e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.252e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ZNF721-202ENST00000505900 664 ntTSL 1 (best)7.11□□□□□ -1.272e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)6.28□□□□□ -1.42e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 52.07□□□□□ -2.082e-8■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 55.88□□□□□ -1.472e-10■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 THOC2-219ENST00000497887 768 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-10■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 34.28□□□□□ -1.722e-10■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 53.81□□□□□ -1.82e-10■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.892e-10■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.072e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.072e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.072e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.8
ILF3Q12906 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-7■■□□□ 13.8
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