Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms