Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms