Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms