Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXO9Q9UK97 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms