Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOPT1Q96IL0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOPT1Q96IL0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOPT1Q96IL0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOPT1Q96IL0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOPT1Q96IL0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms