Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms