Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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