Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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