Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms