Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTGER1P34995 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms