Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLUP10909 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLUP10909 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLUP10909 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLUP10909 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLUP10909 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLUP10909 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLUP10909 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLUP10909 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLUP10909 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLUP10909 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLUP10909 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLUP10909 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLUP10909 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms