Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3LO60238 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms