Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC01558Q9Y6Z2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms