Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.464e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.374e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.134e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-211ENST00000589631 799 ntTSL 321.41■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-204ENST00000585606 2071 ntTSL 220.89■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-210ENST00000589497 853 ntTSL 520.18■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 313.34□□□□□ -0.274e-10■■■■■ 174.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-211ENST00000496139 530 ntTSL 422.49■■□□□ 1.192e-9■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-208ENST00000441936 590 ntTSL 421.83■■□□□ 1.092e-9■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-210ENST00000486163 513 ntTSL 421.79■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-209ENST00000472791 558 ntTSL 417.38■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 IRAK1-209ENST00000444254 783 ntTSL 518.04■□□□□ 0.482e-33■■■■■ 174.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF432-204ENST00000598446 862 ntTSL 319.34■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 174.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 174.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 174.5
UTP3Q9NQZ2 IGF2BP1-206ENST00000515586 768 ntTSL 315.06■□□□□ 02e-18■■■■■ 174.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 174.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 321.51■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 174.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 418.18■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 174.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 317.03■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 174.4
UTP3Q9NQZ2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 174.3
UTP3Q9NQZ2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 174.2
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5C-217ENST00000556218 987 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 174.2
UTP3Q9NQZ2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 174.1
UTP3Q9NQZ2 RBBP6-210ENST00000568015 695 ntTSL 317.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 174.1
UTP3Q9NQZ2 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 174.1
UTP3Q9NQZ2 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 174.1
UTP3Q9NQZ2 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-9■■■■■ 174
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-207ENST00000530238 1817 ntTSL 524.63■■□□□ 1.531e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.465e-10■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-215ENST00000538176 1166 ntTSL 222.69■■□□□ 1.224e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ZBTB21-208ENST00000465968 631 ntTSL 322.65■■□□□ 1.221e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.181e-8■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-207ENST00000466708 1847 ntTSL 222.06■■□□□ 1.124e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF687-207ENST00000459919 840 ntTSL 221.78■■□□□ 1.084e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-206ENST00000463539 1831 ntTSL 220.53■□□□□ 0.884e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-202ENST00000345165 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.01■□□□□ 0.794e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-204ENST00000439619 1064 ntTSL 219.9■□□□□ 0.784e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-214ENST00000485091 1734 ntTSL 218.94■□□□□ 0.624e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-208ENST00000416132 1378 ntTSL 518.78■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF687-202ENST00000336715 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.594e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-212ENST00000460971 1240 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.574e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 PGGHG-201ENST00000397660 578 ntTSL 518.52■□□□□ 0.564e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 NFIC-208ENST00000589537 977 ntTSL 217.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-213ENST00000487365 1312 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-205ENST00000527375 913 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-203ENST00000524699 1131 ntTSL 315.92■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-211ENST00000481804 3248 ntTSL 215.47■□□□□ 0.074e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-208ENST00000530756 963 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-210ENST00000478979 3054 ntTSL 215.37■□□□□ 0.054e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.031e-9■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 NRF1-206ENST00000454688 814 ntTSL 514.75□□□□□ -0.052e-14■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CEP164-213ENST00000533706 5035 ntTSL 514.35□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF687-203ENST00000426871 3277 ntTSL 213.58□□□□□ -0.244e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CCDC78-213ENST00000482878 3458 ntTSL 213.3□□□□□ -0.284e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF687-206ENST00000449313 4185 ntTSL 513.1□□□□□ -0.314e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CEP164-212ENST00000533675 4761 ntTSL 213.04□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 EID2B-202ENST00000601837 281 ntTSL 212.48□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-211ENST00000532668 735 ntTSL 312.43□□□□□ -0.425e-10■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 BTBD9-202ENST00000328403 1968 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.514e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 MANBAL-203ENST00000397150 620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DNTTIP1-202ENST00000415790 591 ntTSL 310.62□□□□□ -0.714e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-219ENST00000550988 795 ntTSL 410.17□□□□□ -0.785e-16■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 CDS2-201ENST00000379070 2713 ntTSL 29.91□□□□□ -0.824e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.834e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 SNW1-201ENST00000261531 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.874e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-224ENST00000552390 842 ntTSL 58.75□□□□□ -1.015e-16■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 SNW1-206ENST00000556428 1966 ntTSL 28.14□□□□□ -1.114e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.144e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 SNW1-207ENST00000557663 602 ntTSL 27.72□□□□□ -1.174e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-214ENST00000550086 384 ntTSL 57.71□□□□□ -1.185e-16■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 UNKL-216ENST00000562537 213 ntTSL 37.44□□□□□ -1.225e-10■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.248e-7■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.294e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 SNW1-203ENST00000554324 584 ntTSL 56.54□□□□□ -1.364e-20■■■■■ 173.9
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-205ENST00000546758 817 ntTSL 56.39□□□□□ -1.395e-16■■■■■ 173.9
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