RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.74■■■■■ 5.55
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.42■■■■■ 4.7
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC9O60706 1549 aa43.8■■■■■ 4.6
GIPC1-211ENST00000589631 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42■■■■■ 4.31
GIPC1-211ENST00000589631 NACADO15069 1562 aa41.87■■■■■ 4.29
GIPC1-211ENST00000589631 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.7■■■■■ 4.27
GIPC1-211ENST00000589631 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.52■■■■■ 4.24
GIPC1-211ENST00000589631 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
GIPC1-211ENST00000589631 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.17■■■■■ 4.18
GIPC1-211ENST00000589631 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.06■■■■■ 4.16
GIPC1-211ENST00000589631 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
GIPC1-211ENST00000589631 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.74■■■■■ 4.11
GIPC1-211ENST00000589631 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.62■■■■■ 4.09
GIPC1-211ENST00000589631 SCRIBQ14160 1630 aa40.42■■■■■ 4.06
GIPC1-211ENST00000589631 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.31■■■■■ 4.04
GIPC1-211ENST00000589631 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
GIPC1-211ENST00000589631 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.63■■■■□ 3.93
GIPC1-211ENST00000589631 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.43■■■■□ 3.9
GIPC1-211ENST00000589631 SMARCA4P51532 1647 aa38.67■■■■□ 3.78
GIPC1-211ENST00000589631 NCAPD3P42695 1498 aa38.65■■■■□ 3.78
GIPC1-211ENST00000589631 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
GIPC1-211ENST00000589631 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.57■■■■□ 3.76
GIPC1-211ENST00000589631 SMARCA2P51531 1590 aa38.52■■■■□ 3.76
GIPC1-211ENST00000589631 HMGXB3Q12766 1538 aa38.39■■■■□ 3.74
GIPC1-211ENST00000589631 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.33■■■■□ 3.73
GIPC1-211ENST00000589631 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.31■■■■□ 3.72
GIPC1-211ENST00000589631 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
GIPC1-211ENST00000589631 WIZO95785 1651 aa37.88■■■■□ 3.65
GIPC1-211ENST00000589631 NESP48681 1621 aa37.79■■■■□ 3.64
GIPC1-211ENST00000589631 ERCC6Q03468 1493 aa37.78■■■■□ 3.64
GIPC1-211ENST00000589631 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
GIPC1-211ENST00000589631 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.68■■■■□ 3.62
GIPC1-211ENST00000589631 CUX2O14529 1486 aa37.58■■■■□ 3.61
GIPC1-211ENST00000589631 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.48■■■■□ 3.59
GIPC1-211ENST00000589631 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
GIPC1-211ENST00000589631 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
GIPC1-211ENST00000589631 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.34■■■■□ 3.57
GIPC1-211ENST00000589631 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
GIPC1-211ENST00000589631 CFTRP13569 1480 aa37.17■■■■□ 3.54
GIPC1-211ENST00000589631 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.05■■■■□ 3.52
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.02■■■■□ 3.52
GIPC1-211ENST00000589631 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.02■■■■□ 3.52
GIPC1-211ENST00000589631 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.01■■■■□ 3.52
GIPC1-211ENST00000589631 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.95■■■■□ 3.51
GIPC1-211ENST00000589631 WDR62O43379 1518 aa36.95■■■■□ 3.5
GIPC1-211ENST00000589631 PRDM2Q13029 1718 aa36.87■■■■□ 3.49
GIPC1-211ENST00000589631 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
GIPC1-211ENST00000589631 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC8Q09428 1581 aa36.42■■■■□ 3.42
GIPC1-211ENST00000589631 TOPBP1Q92547 1522 aa36.39■■■■□ 3.42
GIPC1-211ENST00000589631 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.32■■■■□ 3.4
GIPC1-211ENST00000589631 IFT140Q96RY7 1462 aa36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
GIPC1-211ENST00000589631 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
GIPC1-211ENST00000589631 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
GIPC1-211ENST00000589631 OSCARQ8IYS5 282 aa35.98■■■■□ 3.35
GIPC1-211ENST00000589631 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
GIPC1-211ENST00000589631 CUX1P39880 1505 aa35.95■■■■□ 3.35
GIPC1-211ENST00000589631 SOGA1O94964 1423 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-211ENST00000589631 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-211ENST00000589631 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.88■■■■□ 3.33
GIPC1-211ENST00000589631 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
GIPC1-211ENST00000589631 WDR97A6NE52 1622 aa35.75■■■■□ 3.31
GIPC1-211ENST00000589631 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
GIPC1-211ENST00000589631 CHD1O14646 1710 aa35.6■■■■□ 3.29
GIPC1-211ENST00000589631 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.58■■■■□ 3.29
GIPC1-211ENST00000589631 TOP2BQ02880 1626 aa35.56■■■■□ 3.28
GIPC1-211ENST00000589631 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.56■■■■□ 3.28
GIPC1-211ENST00000589631 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.56■■■■□ 3.28
GIPC1-211ENST00000589631 GRIN2BQ13224 1484 aa35.54■■■■□ 3.28
GIPC1-211ENST00000589631 FBLN2P98095 1184 aa35.52■■■■□ 3.28
GIPC1-211ENST00000589631 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.51■■■■□ 3.28
GIPC1-211ENST00000589631 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
GIPC1-211ENST00000589631 SYNJ1O43426 1573 aa35.49■■■■□ 3.27
GIPC1-211ENST00000589631 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.48■■■■□ 3.27
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM41Q8WV44 630 aa35.46■■■■□ 3.27
GIPC1-211ENST00000589631 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.43■■■■□ 3.26
GIPC1-211ENST00000589631 PBRM1Q86U86 1689 aa35.43■■■■□ 3.26
GIPC1-211ENST00000589631 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.39■■■■□ 3.26
GIPC1-211ENST00000589631 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.39■■■■□ 3.26
GIPC1-211ENST00000589631 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.39■■■■□ 3.26
GIPC1-211ENST00000589631 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
GIPC1-211ENST00000589631 SYNJ2O15056 1496 aa35.35■■■■□ 3.25
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGEF11O15085 1522 aa35.34■■■■□ 3.25
GIPC1-211ENST00000589631 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.21■■■■□ 3.23
GIPC1-211ENST00000589631 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-211ENST00000589631 ADAMTS12P58397 1594 aa35.1■■■■□ 3.21
GIPC1-211ENST00000589631 GRIN2AQ12879 1464 aa35.07■■■■□ 3.2
GIPC1-211ENST00000589631 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.06■■■■□ 3.2
GIPC1-211ENST00000589631 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.06■■■■□ 3.2
GIPC1-211ENST00000589631 ARAP1Q96P48 1450 aa35.02■■■■□ 3.2
GIPC1-211ENST00000589631 NUP160Q12769 1436 aa34.95■■■■□ 3.19
GIPC1-211ENST00000589631 CEP170Q5SW79 1584 aa34.9■■■■□ 3.18
GIPC1-211ENST00000589631 KIF27Q86VH2 1401 aa34.88■■■■□ 3.17
GIPC1-211ENST00000589631 IGF1RP08069 1367 aa34.81■■■■□ 3.16
GIPC1-211ENST00000589631 SHROOM2Q13796 1616 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-211ENST00000589631 CUL7Q14999 1698 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-211ENST00000589631 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.66■■■■□ 3.14
GIPC1-211ENST00000589631 JPH4Q96JJ6 628 aa34.62■■■■□ 3.13
GIPC1-211ENST00000589631 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms