RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.72■■■■■ 4.91
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.64■■■■■ 4.1
GIPC1-210ENST00000589497 ABCC9O60706 1549 aa40.07■■■■■ 4.01
GIPC1-210ENST00000589497 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.62■■■■□ 3.77
GIPC1-210ENST00000589497 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.44■■■■□ 3.74
GIPC1-210ENST00000589497 NACADO15069 1562 aa38.33■■■■□ 3.73
GIPC1-210ENST00000589497 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
GIPC1-210ENST00000589497 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.98■■■■□ 3.67
GIPC1-210ENST00000589497 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.77■■■■□ 3.64
GIPC1-210ENST00000589497 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.6
GIPC1-210ENST00000589497 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.41■■■■□ 3.58
GIPC1-210ENST00000589497 SCRIBQ14160 1630 aa37.17■■■■□ 3.54
GIPC1-210ENST00000589497 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.15■■■■□ 3.54
GIPC1-210ENST00000589497 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.9■■■■□ 3.5
GIPC1-210ENST00000589497 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.8■■■■□ 3.48
GIPC1-210ENST00000589497 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-210ENST00000589497 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.17■■■■□ 3.38
GIPC1-210ENST00000589497 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.02■■■■□ 3.36
GIPC1-210ENST00000589497 SMARCA4P51532 1647 aa35.48■■■■□ 3.27
GIPC1-210ENST00000589497 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
GIPC1-210ENST00000589497 NCAPD3P42695 1498 aa35.37■■■■□ 3.25
GIPC1-210ENST00000589497 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.37■■■■□ 3.25
GIPC1-210ENST00000589497 SMARCA2P51531 1590 aa35.34■■■■□ 3.25
GIPC1-210ENST00000589497 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.23■■■■□ 3.23
GIPC1-210ENST00000589497 HMGXB3Q12766 1538 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-210ENST00000589497 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-210ENST00000589497 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.08■■■■□ 3.21
GIPC1-210ENST00000589497 WIZO95785 1651 aa34.84■■■■□ 3.17
GIPC1-210ENST00000589497 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
GIPC1-210ENST00000589497 ERCC6Q03468 1493 aa34.63■■■■□ 3.13
GIPC1-210ENST00000589497 NESP48681 1621 aa34.58■■■■□ 3.13
GIPC1-210ENST00000589497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.46■■■■□ 3.11
GIPC1-210ENST00000589497 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
GIPC1-210ENST00000589497 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.4■■■■□ 3.1
GIPC1-210ENST00000589497 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.34■■■■□ 3.09
GIPC1-210ENST00000589497 CUX2O14529 1486 aa34.2■■■■□ 3.06
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.11■■■■□ 3.05
GIPC1-210ENST00000589497 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.1■■■■□ 3.05
GIPC1-210ENST00000589497 CFTRP13569 1480 aa34.09■■■■□ 3.05
GIPC1-210ENST00000589497 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
GIPC1-210ENST00000589497 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.99■■■■□ 3.03
GIPC1-210ENST00000589497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
GIPC1-210ENST00000589497 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.96■■■■□ 3.03
GIPC1-210ENST00000589497 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.92■■■■□ 3.02
GIPC1-210ENST00000589497 WDR62O43379 1518 aa33.74■■■□□ 2.99
GIPC1-210ENST00000589497 PRDM2Q13029 1718 aa33.72■■■□□ 2.99
GIPC1-210ENST00000589497 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
GIPC1-210ENST00000589497 ABCC8Q09428 1581 aa33.45■■■□□ 2.95
GIPC1-210ENST00000589497 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.42■■■□□ 2.94
GIPC1-210ENST00000589497 TOPBP1Q92547 1522 aa33.39■■■□□ 2.94
GIPC1-210ENST00000589497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.32■■■□□ 2.92
GIPC1-210ENST00000589497 IFT140Q96RY7 1462 aa33.26■■■□□ 2.92
GIPC1-210ENST00000589497 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
GIPC1-210ENST00000589497 SOGA1O94964 1423 aa33.06■■■□□ 2.88
GIPC1-210ENST00000589497 CUX1P39880 1505 aa33.05■■■□□ 2.88
GIPC1-210ENST00000589497 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.01■■■□□ 2.88
GIPC1-210ENST00000589497 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.99■■■□□ 2.87
GIPC1-210ENST00000589497 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
GIPC1-210ENST00000589497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.93■■■□□ 2.86
GIPC1-210ENST00000589497 OSCARQ8IYS5 282 aa32.93■■■□□ 2.86
GIPC1-210ENST00000589497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
GIPC1-210ENST00000589497 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
GIPC1-210ENST00000589497 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.88■■■□□ 2.85
GIPC1-210ENST00000589497 FBLN2P98095 1184 aa32.77■■■□□ 2.84
GIPC1-210ENST00000589497 TOP2BQ02880 1626 aa32.73■■■□□ 2.83
GIPC1-210ENST00000589497 WDR97A6NE52 1622 aa32.72■■■□□ 2.83
GIPC1-210ENST00000589497 SYNJ1O43426 1573 aa32.7■■■□□ 2.82
GIPC1-210ENST00000589497 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.69■■■□□ 2.82
GIPC1-210ENST00000589497 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.66■■■□□ 2.82
GIPC1-210ENST00000589497 GRIN2BQ13224 1484 aa32.64■■■□□ 2.82
GIPC1-210ENST00000589497 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.63■■■□□ 2.81
GIPC1-210ENST00000589497 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
GIPC1-210ENST00000589497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.6■■■□□ 2.81
GIPC1-210ENST00000589497 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
GIPC1-210ENST00000589497 CHD1O14646 1710 aa32.51■■■□□ 2.79
GIPC1-210ENST00000589497 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.47■■■□□ 2.79
GIPC1-210ENST00000589497 PBRM1Q86U86 1689 aa32.46■■■□□ 2.79
GIPC1-210ENST00000589497 SYNJ2O15056 1496 aa32.42■■■□□ 2.78
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM41Q8WV44 630 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-210ENST00000589497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-210ENST00000589497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.25■■■□□ 2.75
GIPC1-210ENST00000589497 KIF27Q86VH2 1401 aa32.24■■■□□ 2.75
GIPC1-210ENST00000589497 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-210ENST00000589497 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-210ENST00000589497 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGEF11O15085 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
GIPC1-210ENST00000589497 ADAMTS12P58397 1594 aa32.19■■■□□ 2.74
GIPC1-210ENST00000589497 GRIN2AQ12879 1464 aa32.18■■■□□ 2.74
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GIPC1-210ENST00000589497 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.12■■■□□ 2.73
GIPC1-210ENST00000589497 IGF1RP08069 1367 aa32.09■■■□□ 2.73
GIPC1-210ENST00000589497 NUP160Q12769 1436 aa32.01■■■□□ 2.72
GIPC1-210ENST00000589497 CEP170Q5SW79 1584 aa31.98■■■□□ 2.71
GIPC1-210ENST00000589497 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-210ENST00000589497 CUL7Q14999 1698 aa31.94■■■□□ 2.7
GIPC1-210ENST00000589497 ARAP1Q96P48 1450 aa31.92■■■□□ 2.7
GIPC1-210ENST00000589497 JPH4Q96JJ6 628 aa31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-210ENST00000589497 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-210ENST00000589497 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
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