Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms