Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC25A48Q6ZT89 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms