Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD12Q587J7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms