Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms