Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP7Q16576 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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