Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms