Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms