Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms