Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms