Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3CQ5T2N8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms