Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAPTM4AQ15012 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms