Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms