Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYKP34925 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYKP34925 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYKP34925 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYKP34925 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms