Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF2P15336 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF2P15336 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms