Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms