Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMIM1B2RUZ4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms