Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMED7Q9Y3B3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms