Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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