Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms