Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREML4Q6UXN2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms