Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms