Protein–RNA interactions for Protein: Q5T230

UTF1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTF1Q5T230 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTF1Q5T230 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms