Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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ITGA9Q13797 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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