Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 521.5■■□□□ 1.036e-8■■■□□ 18.1
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PABPC4Q13310 TXNRD2-207ENST00000462843 810 ntTSL 320.37■□□□□ 0.856e-8■■■□□ 18.1
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PABPC4Q13310 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 18.1
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PABPC4Q13310 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.36e-6■■■□□ 18.1
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PABPC4Q13310 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 18.1
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PABPC4Q13310 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.631e-6■■■□□ 18.1
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PABPC4Q13310 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.238e-8■■■□□ 18
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PABPC4Q13310 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.664e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 METTL9-203ENST00000562379 701 ntTSL 225.05■■□□□ 1.62e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.52e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.452e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 METTL9-210ENST00000570074 447 ntTSL 323.98■■□□□ 1.432e-7■■■□□ 18
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PABPC4Q13310 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-7■■■□□ 18
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PABPC4Q13310 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.982e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 IMP4-211ENST00000464432 939 ntTSL 520.9■□□□□ 0.942e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.938e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CCS-205ENST00000530384 1196 ntTSL 520.47■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ATG101-207ENST00000553049 846 ntTSL 220.4■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-220ENST00000498431 667 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.766e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.724e-6■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.716e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 IMP4-202ENST00000409649 822 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 IMP4-204ENST00000428740 924 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 CCS-206ENST00000530961 1214 ntTSL 518.06■□□□□ 0.482e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-7■■■□□ 18
PABPC4Q13310 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.476e-14■■■□□ 18
PABPC4Q13310 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 18
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