Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK8P49336 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK8P49336 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms