Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA1P15085 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms