Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HKR1P10072 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HKR1P10072 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms