Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms