Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MID1IP1Q9NPA3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MID1IP1Q9NPA3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms