Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAX2Q96IS3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAX2Q96IS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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